かつて陸の孤島と呼ばれた葦北の地に、地域人材の育成、産業・文化の振興を期して大正１０年に葦北農林学校が創立されました。一方、地域子女の教育のために昭和２年に芦北実科高等女学校が設立されました。この両校は戦後の学制改革により、統合され、昭和２３年に芦北農林高等学校となり、『敬愛・勤勉・創造』の校訓のもとに四学科体制で再出発しました。その後、昭和５７年に芦北高等学校と校名変更されました。
　時代と地域の要請により、平成１４年家政科に代わって福祉科が設立しました。総合高校の特色を活かし、今世紀人類最大の課題である『食・いのち・環境・資源』を教育の中心に捉えています。
　平成１９年には、普通科（１クラス）が募集停止となり、特色ある三学科（３クラス）の専門高校として現在に至ります。また、平成２３年から本校内に芦北支援学校高等部佐敷分教室が設置されています。
　令和３年１１月に創立１００周年記念式典を挙行、盛大に祝いました。１５，０００人を超える卒業生は、農林業をはじめ、政治・経済、法曹・行政・教育・芸術の各分野で活躍しています。